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Aunque se han hecho inversiones importantes para la investigación de esta enfermedad, todavía no existe un tratamiento efectivo ya que sigue desconociéndose el agente causal, aunque se recomienda adoptar una serie de medidas preventivas.
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Aunque sigue desconociéndose el agente causal de la Enterocolitis y por tanto no se dispone todavía de un tratamiento efectivo, las últimas investigaciones sobre su forma de transmisión y sobre su evolución hacen recomendable adoptar una serie de medidas preventivas para evitar su transmisión entre explotaciones o entre bandas en una misma explotación:

1. Evitar la redistribución de alimento que haya estado en contacto con animales enfermos al resto de animales de la explotación.
2. Evitar el contacto de los animales con material fecal procedente de animales enfermos. Para ello es de gran importancia la limpieza de las jaulas, fosas, etc.
3. Evitar el contacto de los conejos con animales muertos.
4. Evitar las visitas al máximo posible, o usar las protecciones sanitarias adecuadas.
5. Realizar un correcto manejo.
6. Controlar el consumo de agua y de alimento, ya que constituyen una herramienta útil de vigilancia.
7. Controlar la calidad del agua de limpieza.

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